Расследование было проведено, однако на обратном пути в Москву, между Пермью и Вяткой, в вагон ворвались красноармейцы. Всех троих членов комиссии убили — расстреляли и изрубили шашками — а тела выбросили из поезда. Это произошло за мостом через реку Каму, в районе современного микрорайона Пролетарский города Перми. Материалы расследования и крупная сумма денег, предназначенная для Поместного Собора, исчезли.